miRNA靶点预测及验证之合成篇
miRNA靶点预测
miRNA(microRNA) 是一类长度约19-24nt的非编码单链RNA,通过碱基互补配对的方式与靶基因的3'UTR区部分或完全互补,剪切靶基因的转录产物或者抑制转录产物的翻译,从而起到转录后调控靶基因表达的作用。
当前,miRNA对靶基因的功能研究仍然是世界研究热点之一。一般研究思路为:(1) 利用生物信息学方法准确快速地预测miRNA的靶基因,为研究miRNA功能提供线索; (2) 再利用荧光素酶报告基因检测系统验证miRNA对靶点的作用。泓迅科技可为您提供miRNA报告基因载体构建服务,您只需要提供目的miRNA靶位点序列,专业技术人员即可替您完成载体构建,为您节省大量的时间和精力。
利用基因合成方法可以快速构建含靶基因3'UTR的双荧光素酶报告基因载体,将其与表达pre-miRNA的质粒或化学合成的miRNA mimics共转染细胞后,可进行双荧光素酶检测,进一步验证目的miRNA的靶位点。
1. miRNA靶点的预测利用Targetscan、miRDB、PicTar软件预测靶基因3'UTR与miRNA的结合位点。
2. 根据软件预测的靶基因3'UTR与miRNA的结合位点,直接进行基因合成,插入到双荧光素酶报告基因载体上,构建含靶基因3'UTR的双荧光素酶报告基因载体。
3.合成相应的miRNA mimics或直接基因合成构建表达pre-miRNA的质粒。
4.将靶基因3'UTR的双荧光素酶报告基因载体和miRNA mimics或表达pre-miRNA的质粒共转染293T或Hela细胞。
5.荧光素酶检测共转染细胞24-72h后,进行双荧光素酶检测,验证目的miRNA的靶位点。
双荧光素载体构建服务优势:
1. Ready-to-Use载体,专业的技术咨询
2. 快速基因合成,最短载体构建周期
3. 去内毒素的大量质粒制备,可直接用于细胞转染
4. 有竞争力的价格体系
miRNA表达检测之qPCR
miRNA广泛存在于动物、植物、真菌及病毒的基因组中,调控生物体生长发育和疾病发生等过程中相关基因的表达。miRNA的异常表达可能会导致生理状态的异常和疾病的产生,在多种癌症中,其表达水平会发生明显改变,有可能起到原癌基因和抑癌基因的作用。此外,在许多其他病变组织和细胞中也检测到了miRNA的异常表达。因此,对miRNA表达的研究具有重要意义。
miRNA长度很短,无法用Oligo (dT)18或6N进行逆转录,泓迅科技提供茎环法逆转录引物、相应的扩增引物和/或特异性TaqMan探针合成方案,即可对其进行荧光定量。除常用的染料法和TaqMan探针外,还可选择设计合成TaqMan-MGB探针,其探针设计得更短,特异性更高。
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